mySQL5.5にしました。
UTF-8をデフォルトの文字コードに設定した方が何かと楽なのでいつもの3行を追加しましたが2つしか受け付けませんでした。その他、チューニングはphpMyAdminを使って言われるとおりちょこちょこ変更しては様子見ですね。

# rpm -ivh http://dl.fedoraproject.org/pub/epel/5/i386/epel-release-5-4.noarch.rpm
# rpm -ivh http://rpms.famillecollet.com/enterprise/remi-release-5.rpm
# yum --enablerepo=remi install mysql-server
# mysql_install_db --datadir=/var/lib/mysql --user=mysql
# /etc/rc.d/init.d/mysqld start
unknown variable 'default-character-set=utf8'
↓
# vi /etc/my.cnf
character-set-server = utf8
skip-character-set-client-handshake
だけに変更